В отделе хранения основных фондов собрано около 1, 3 млн. изданий, хранятся с прошлых веков исторические материалы, а также материалы из разных отраслей знаний, как ценные наследие для будущего поколения.
Основная задача отдела удовлетворение потребности читателей, своевременное качественное обслуживание.
При отделе есть Картографический фонд Библиотеки, который является одним из крупнейших в Кыргызстане (более 500 карт), включает различные по назначению (физические, политические, исторические, топографические, панорамные, и др.), полиграфическому исполнению и месту создания (отечественные и зарубежные) карты и картосхемы. Имеются планы населенных пунктов, а также карты, отражающие административно-территориальное деление областей и районов.
